Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IRF5Q13568 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181 ms