Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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