Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTK7Q13308 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTK7Q13308 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.3 ms