Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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