Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPAQ15257 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms