Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM25Q14258 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRIM25Q14258 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms