Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLN3Q13286 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
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