Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms