Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAPPC13A5PLN9 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
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