Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
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SH3BP1Q9Y3L3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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SH3BP1Q9Y3L3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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SH3BP1Q9Y3L3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1Q9Y3L3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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