Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms