Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FBXO4Q9UKT5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms