Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNA3Q9UI47 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms