Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms