Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBQLN2Q9UHD9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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