Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms