Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM5BQ9UGL1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms