Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRBP1Q9P2E9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms