Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms