Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF3Q9H094 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms