Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms