Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NLRP1Q9C000 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms