Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM153A-216ENST00000510276 1641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNASE2B-201ENST00000370662 1130 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 VN1R33P-201ENST00000411800 887 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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KRTAP9-4Q9BYQ2 AL359475.1-201ENST00000414505 292 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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KRTAP9-4Q9BYQ2 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 SERPINB5-205ENST00000489441 1268 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02200-203ENST00000513687 541 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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KRTAP9-4Q9BYQ2 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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KRTAP9-4Q9BYQ2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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KRTAP9-4Q9BYQ2 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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KRTAP9-4Q9BYQ2 AL359532.1-201ENST00000608729 1560 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 DYNLL1-202ENST00000392508 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 ITPKB-IT1-201ENST00000412918 746 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-4Q9BYQ2 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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