Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHANK3Q9BYB0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms