Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF3

CECR2, Cat eye syndrome critical region protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CECR2Q9BXF3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CECR2Q9BXF3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CECR2Q9BXF3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CECR2Q9BXF3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CECR2Q9BXF3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CECR2Q9BXF3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CECR2Q9BXF3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CECR2Q9BXF3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CECR2Q9BXF3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
CECR2Q9BXF3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
CECR2Q9BXF3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CECR2Q9BXF3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CECR2Q9BXF3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CECR2Q9BXF3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CECR2Q9BXF3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CECR2Q9BXF3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CECR2Q9BXF3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CECR2Q9BXF3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CECR2Q9BXF3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CECR2Q9BXF3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
CECR2Q9BXF3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CECR2Q9BXF3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CECR2Q9BXF3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CECR2Q9BXF3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CECR2Q9BXF3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms