Protein–RNA interactions for Protein: Q99942

RNF5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF5Q99942 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF5Q99942 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF5Q99942 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF5Q99942 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF5Q99942 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF5Q99942 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF5Q99942 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF5Q99942 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF5Q99942 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF5Q99942 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF5Q99942 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF5Q99942 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF5Q99942 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF5Q99942 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF5Q99942 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF5Q99942 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF5Q99942 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF5Q99942 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF5Q99942 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF5Q99942 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF5Q99942 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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