Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALS2Q96Q42 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms