Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCANQ96GW7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BCANQ96GW7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCANQ96GW7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BCANQ96GW7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCANQ96GW7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCANQ96GW7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BCANQ96GW7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BCANQ96GW7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC27.57■■■□□ 2
BCANQ96GW7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
BCANQ96GW7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BCANQ96GW7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCANQ96GW7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCANQ96GW7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCANQ96GW7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.57■■■□□ 2
BCANQ96GW7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCANQ96GW7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCANQ96GW7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
BCANQ96GW7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCANQ96GW7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BCANQ96GW7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BCANQ96GW7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BCANQ96GW7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BCANQ96GW7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BCANQ96GW7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BCANQ96GW7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
BCANQ96GW7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BCANQ96GW7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BCANQ96GW7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BCANQ96GW7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BCANQ96GW7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BCANQ96GW7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BCANQ96GW7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BCANQ96GW7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BCANQ96GW7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BCANQ96GW7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BCANQ96GW7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BCANQ96GW7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BCANQ96GW7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BCANQ96GW7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BCANQ96GW7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BCANQ96GW7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
BCANQ96GW7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BCANQ96GW7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BCANQ96GW7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BCANQ96GW7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC27.55■■■□□ 2
BCANQ96GW7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.55■■■□□ 2
BCANQ96GW7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BCANQ96GW7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BCANQ96GW7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BCANQ96GW7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BCANQ96GW7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BCANQ96GW7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BCANQ96GW7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BCANQ96GW7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
BCANQ96GW7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
BCANQ96GW7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BCANQ96GW7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BCANQ96GW7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BCANQ96GW7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC27.54■■■□□ 2
BCANQ96GW7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
BCANQ96GW7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
BCANQ96GW7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.54■■■□□ 2
BCANQ96GW7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BCANQ96GW7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BCANQ96GW7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BCANQ96GW7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BCANQ96GW7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BCANQ96GW7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BCANQ96GW7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
BCANQ96GW7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BCANQ96GW7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BCANQ96GW7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
BCANQ96GW7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BCANQ96GW7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BCANQ96GW7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC27.53■■■□□ 2
BCANQ96GW7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BCANQ96GW7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BCANQ96GW7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
BCANQ96GW7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BCANQ96GW7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BCANQ96GW7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BCANQ96GW7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BCANQ96GW7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BCANQ96GW7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BCANQ96GW7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BCANQ96GW7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BCANQ96GW7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BCANQ96GW7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BCANQ96GW7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BCANQ96GW7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BCANQ96GW7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BCANQ96GW7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
BCANQ96GW7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC27.52■■■□□ 2
BCANQ96GW7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms