Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTV1Q96GA3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms