Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms