Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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