Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms