Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTOP1Q7RTM1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTOP1Q7RTM1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms