Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms