Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms