Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms