Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms