Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms