Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NHSL1Q5SYE7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms