Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC39AQ5SRH9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC39AQ5SRH9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC39AQ5SRH9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC39AQ5SRH9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC39AQ5SRH9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC39AQ5SRH9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC39AQ5SRH9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC39AQ5SRH9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC39AQ5SRH9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC39AQ5SRH9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC39AQ5SRH9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC39AQ5SRH9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC39AQ5SRH9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC39AQ5SRH9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms