Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms