Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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