Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCN9AQ15858 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN9AQ15858 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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