Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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