Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms