Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF1Q15361 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
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