Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX1-1Q15270 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms