Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDGFRLQ15198 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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