Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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