Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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COL4A6Q14031 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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COL4A6Q14031 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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COL4A6Q14031 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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COL4A6Q14031 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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COL4A6Q14031 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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COL4A6Q14031 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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COL4A6Q14031 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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COL4A6Q14031 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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COL4A6Q14031 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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COL4A6Q14031 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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COL4A6Q14031 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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COL4A6Q14031 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL4A6Q14031 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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